入るたびに形がかわるダンジョンが特徴の「不思議のダンジョンシリーズ」と「ポケモンシリーズ」が1つになった「ポケモンダンジョンシリーズ」の第2弾。一度ダンジョン内でゲームオーバーになってもキャラクターのレベル・ステータスはリセットされることはなく、従来の「不思議のダンジョンシリーズ」よりも遊びやすい内容になっています。今作では「ポケモンダイヤモンド/パール」のポケモンたちが490種類以上登場、前作は困っているポケモンを救助するといった内容でしたが、今作は「不思議のダンジョン」を探検し、世界を危機に陥れようとする謎のポケモンを追う為、冒険にでるといったストーリーになっています。ダンジョン内でゲームオーバーになった際、Wi‐Fi通信を利用して救助を要請することが可能、加えて今作ではフレンド登録をしている友人の携帯電話・Wiiに救助要請のメールを送信することが出来ます。（4902370516203 NDS ポケモンフシギノダンジョン トキノタンケンタイ NDS ポケモン不思議のダンジョン 時の探検隊 任天堂 20070913 ポケットモンスター）
